Jojo Rabbit (Tavşan Jojo), annesinin evinde sakladığı bir kızı öğrenen genç Jojo Betzler'in hikayesini anlatıyor. Hitler Gençliği kamplarında yer alan Jojo, annesinin Yahudi bir kızı gizlice misafir ettiğini keşfeder. Bu kız, evlerinin çatı katında saklanmaktadır. Jojo'nun en yakın sırdaşı ise hayali arkadaşı Adolf Hitler'dir; ancak bu Hitler, gerçekteki gibi değil, Jojo'nun zihninde canlandırdığı şekliyle oldukça farklıdır. Jojo, bu yeni durumu anlamlandırmaya çalışırken, içindeki karmaşayla mücadele eder. Hayali arkadaşı Hitler'in etkisine rağmen, Jojo, korkunç ırkçılığa karşı durmak ve kendi insanlığını bulmak için mücadele etmeye başlar. Jojo Rabbit, hem mizahi hem de duygusal bir tonla, genç bir çocuğun gözünden savaşı ve insanlığın en karanlık yönleriyle başa çıkma çabasını anlatıyor.